O mestre da ficção cientifica animada, Masamune Shirow, criador de obras primas como Ghost in the Shell, nos transporta, em Appleseed, a um mundo situado no fim da terceira guerra mundial, mais precisamente em 2131, com grande parte da terra destruida e umas poucas cidades remanecentes, onde a humanidade vive junto com uma raça de humanos artificiais chamados "Bioroids" ("Biologic Androids", Androides biológicos), e também com muitas pessoas que devido a guerra, perderam partes do seus corpo que foram resconstituidos, e que com a ajuda da técnologia são agora cyborgs.